Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Spta1P08032 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms