Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Eb1P04230 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Eb1P04230 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Eb1P04230 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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H2-Eb1P04230 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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H2-Eb1P04230 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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