Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AurkcO88445 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms