Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Foxq1O70220 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Foxq1O70220 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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