Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnk2O54967 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tnk2O54967 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnk2O54967 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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