Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CrxO54751 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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CrxO54751 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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