Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Kpna3O35344 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms