Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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MttpO08601 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MttpO08601 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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MttpO08601 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MttpO08601 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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MttpO08601 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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MttpO08601 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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MttpO08601 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MttpO08601 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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