Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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