Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp35M0QWN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms