Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl4M0QW46 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms