Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccer2J3QPU5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms