Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim22J3QP37 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim22J3QP37 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms