Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc180J3QNE4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc180J3QNE4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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