Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20918J3QN17 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms