Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20830J3KML6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms