Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1bF6V0H0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pagr1bF6V0H0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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