Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms