Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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