Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms