Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt78E9Q0F0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms