Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20425E9Q035 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms