Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ryr1E9PZQ0 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms