Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd1E9PZ26 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms