Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms