Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms