Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde2E9PUP1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms