Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms