Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cttnbp2B9EJA2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2B9EJA2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms