Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia4B8QI36 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms