Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp26c1B2RXA7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp26c1B2RXA7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms