Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otud7bB2RUR8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms