Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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