Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms