Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spocd1B1ASB6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms