Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PtprsB0V2N1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprsB0V2N1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PtprsB0V2N1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PtprsB0V2N1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprsB0V2N1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms