Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Palm3A2TJV2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms