Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rtf1A2AQ19 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms