Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ckap5A2AGT5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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