Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb4A2A863 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms