Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RNP2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms