Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3550W4VSN7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms