Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms