Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Knop1Q9Z2Q2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms