Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd3Q9Z2D8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms