Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syngr4Q9Z1L2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms