Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cpne6Q9Z140 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms