Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X0

Cdc42ep5, Cdc42 effector protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms