Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stxbp4Q9WV89 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms