Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam50bQ9WTJ8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms